醫療廢物高溫滅菌法是指殺死或除去醫療廢物中所有微生物的方法，微生物包括細菌、真菌、病毒等，凡有生命的地方都有微生物，而且繁殖很快。細菌的芽孢具有較強的抗熱力，不易殺死， 組成細胞的蛋白質分子的功能取決于它的特殊結構，在一定的高溫條件下受熱時，蛋白質分子內氫鍵發生斷裂影響了分子空間構型的重排，從而導致微生物的死亡。

高溫蒸汽消毒處理工藝是公認的可靠的濕熱滅菌法。由于蒸汽比熱大，穿透力強， 同時其冷凝時釋放出大量的潛熱，更容易使蛋白變性。在 220kPa、134℃以上，維持 45 分鐘，能殺滅微生物，包括醫療衛生行業標準的耐熱生物指示劑——嗜熱脂肪桿菌芽孢。高溫蒸汽消毒處理法是一種簡便、可靠、經濟、快速、沒有二次污染的處置方法， 已在國內天津市、三亞市等城市得到廣泛應用。